Junto a la Oficina de Crímenes de Guerra de American University, el Laboratorio implementó el proyecto Aumentando el impacto de la Jurisdicción Especial para la Paz desde un enfoque holística de la justicia transicional. El proyecto se fundamentó en cuatro metas: metas: I) fortalecer la capacidad de la JEP para que aquellos máximos responsables de crímenes atroces cometidos durante el conflicto armado sean llamados a rendir cuentas, II) contribuir a la aplicación del enfoque de género y de enfoques diferenciales en la investigación y atención a las víctimas, III) aumentar la participación de víctimas en los diferentes procesos adelantados por la Jurisdicción y IV) apoyar los esfuerzos para una efectiva representación jurídica tanto de víctimas como de comparecientes.

Además del apoyo a casos concretos, a través de la puesta en marcha de diferentes metodologías de investigación y de análisis jurídico, el proyecto también ha colaborado con distintas dependencias de la Jurisdicción para, por ejemplo, evaluar el modelo de gestión judicial de la JEP o la implementación del enfoque de género en sus distintas actuaciones.